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            邁克·沃特曼

            邁克·沃特曼

            邁克·沃特曼(Michael S. Waterman,1942年6月-),生于美國(guó)俄勒岡州Bandon,畢業(yè)于美國(guó)密歇根州立大學(xué),生物學(xué)家,數(shù)學(xué)家,計(jì)算科學(xué)家,教育科研工作者。

            他長(zhǎng)期致力于將數(shù)學(xué)理論和計(jì)算機(jī)技術(shù)應(yīng)用于生物問(wèn)題,他是生物信息學(xué)和計(jì)算生物學(xué)的奠基人之一。


            人物經(jīng)歷

            1942年,生于美國(guó)俄勒岡州Bandon。

            1969年,獲美國(guó)密歇根州立大學(xué)概率論與數(shù)理統(tǒng)計(jì)博士學(xué)位。

            1995年,當(dāng)選為美國(guó)藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院院士。

            2001年,當(dāng)選為美國(guó)科學(xué)院院士。

            2008年起,他受聘為清華大學(xué)講席教授。

            邁克·沃特曼

            2012年,當(dāng)選為美國(guó)工程院院士。

            2013年,當(dāng)選中國(guó)科學(xué)院外籍院士。

            主要成就

            科研成就

            科研綜述

            邁克·沃特曼是計(jì)算生物學(xué)奠基人之一,他致力于將數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)、計(jì)算機(jī)科學(xué)應(yīng)用于分子生物學(xué)問(wèn)題中,開(kāi)辟了多個(gè)重要研究方向。他與Smith發(fā)展的Smith-Waterman算法奠定了生物信息學(xué)算法的基礎(chǔ),他與Lander發(fā)展的生物序列映射數(shù)學(xué)模型成為人類(lèi)基因組計(jì)劃的重要理論基石,他與Pevzner發(fā)展的歐拉圖組裝方法是新一代測(cè)序中所有大規(guī)模短序列拼裝算法的基礎(chǔ),他的工作在數(shù)學(xué)界和計(jì)算機(jī)界也有廣泛和深遠(yuǎn)的影響。序列比對(duì)是研究核酸和蛋白質(zhì)序列中的最基本任務(wù),在生物學(xué)多個(gè)領(lǐng)域有重要應(yīng)用。他在早期為這一領(lǐng)域奠定了堅(jiān)實(shí)、嚴(yán)格的理論基礎(chǔ)。序列數(shù)據(jù)庫(kù)搜索的核心是發(fā)現(xiàn)兩個(gè)序列中最相近的片斷,Smith-Waterman(S-W)算法實(shí)現(xiàn)了二項(xiàng)式復(fù)雜度,之后擴(kuò)展為尋找k個(gè)無(wú)交疊的比對(duì)片斷,成為生物序列比對(duì)算法的經(jīng)典和基礎(chǔ),被絕大多數(shù)生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)采用。人類(lèi)基因組計(jì)劃的一個(gè)關(guān)鍵是對(duì)未知基因組進(jìn)行隨機(jī)采樣后通過(guò)讀段重疊構(gòu)造基因組物理圖譜。Lander和沃特曼提出了覆蓋度分析的數(shù)學(xué)模型,在人類(lèi)基因組計(jì)劃中發(fā)揮了重要的作用,成為該計(jì)劃和其他基因組測(cè)序的重要理論基礎(chǔ)。現(xiàn)在,這一模型已被擴(kuò)展到宏基因組等更多領(lǐng)域中。在人類(lèi)基因組計(jì)劃中,直到2001年,序列都是通過(guò)重疊-布局-共識(shí)方式確定。隨著新一代測(cè)序技術(shù)發(fā)展,讀段數(shù)目大大增加使這種方法無(wú)法實(shí)現(xiàn)。他開(kāi)拓性地提出了基于歐拉圖(也叫De Bruijn圖)的技術(shù),完全重新定義了這個(gè)問(wèn)題,這種圖搜索的技術(shù)路線成為新一代測(cè)序中序列拼接組裝的基礎(chǔ),多數(shù)新一代測(cè)序組裝軟件都采用了這種方法或其變形。

            早在1997年,邁克·沃特曼應(yīng)邀出席在內(nèi)蒙古的一個(gè)學(xué)術(shù)會(huì)議并訪問(wèn)北京大學(xué),他那次訪問(wèn)和學(xué)術(shù)報(bào)告對(duì)中國(guó)早期計(jì)算生物學(xué)研究產(chǎn)生了很大的影響。2008年起,他受聘為清華大學(xué)講席教授,領(lǐng)導(dǎo)由7位海外杰出學(xué)者組成的教授組在清華開(kāi)展工作。他對(duì)我國(guó)其他高校和中科院科研所也做了很多貢獻(xiàn)。他與北大錢(qián)敏平教授與陳永川院士領(lǐng)導(dǎo)的南開(kāi)大學(xué)組合數(shù)學(xué)中心有密切的學(xué)術(shù)聯(lián)系;他指導(dǎo)過(guò)的多位中國(guó)博士后和訪問(wèn)學(xué)者現(xiàn)已成為中科院的學(xué)術(shù)骨干。他對(duì)中國(guó)國(guó)際學(xué)術(shù)交流也作出了巨大貢獻(xiàn)。2009年,他擔(dān)任在北京召開(kāi)的APBC2009大會(huì)程序委員會(huì)共同主席并做主題報(bào)告,并擔(dān)任上海IJCBS國(guó)際會(huì)議名譽(yù)主席。在他的建議和幫助下,本領(lǐng)域最有學(xué)術(shù)影響的RECOMB年會(huì)2013年在清華大學(xué)召開(kāi)。

            榮譽(yù)表彰

            1995年,當(dāng)選為美國(guó)藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院院士。

            2001年,當(dāng)選為美國(guó)科學(xué)院院士。

            2012年,當(dāng)選為美國(guó)工程院院士。

            2013年,當(dāng)選中國(guó)科學(xué)院外籍院士。

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